تسعى الوحدة إلى تحقيق الأهداف الآتية :
– غرس الأسس الأخلاقية والاعتقادية والسلوكية الصحيحة في طلاب الوحدة؛ ليكونوا قادرين على العمل البناء في مجتمعاتهم وأوطانهم.
– تكوين الشخصية العلمية المتزنة في فهمها العميق والشامل للقرآن الكريم والسنة النبوية الشريفة والأحكام الشرعية المستنبطة منهما.
– التعريف بأسس الحضارة الإسلامية وإبراز خصائص المجتمع المسلم نحو قضايا الأسرة والمجتمع والسياسة والاقتصاد.. من خلال مواد الإعداد العام.
– إعداد متخصصين في علوم الشريعة مؤهلين لمعرفة حكم الله تعالى في كل ما يستجد من أمور الحياة الشرعية والاقتصادية والاجتماعية والإدارية.
– إعداد البحوث والدراسات الإسلامية التي تهدف إلى خدمة الإسلام والمسلمين.
– إيجاد الحلول الإسلامية المناسبة للمشكلات التي تثيرها النظريات والنظم الوضعية.